La Escuela de Odontología fue fundada en noviembre de 1978, respondiendo a la necesidad de contar con profesionales de la salud bucal en la región noroeste del país. Esta carrera formó parte del Instituto de Ciencias de la Salud (INCISA), en el que se agrupaban las carreras de Medicina, Odontología y Veterinaria. Dicho Instituto nace como producto de la investigación sobre necesidades regionales para esta área, realizada por el CEPPAS (Centro de Estudios Profesionales para la Salud) que funcionó en la UAS en 1975/78. En 1982 Odontología se separa de INCISA, constituyéndose como una escuela. Actualmente está constituida como Facultad ya que contamos con Posgrados como la Maestría de Ortodoncia, Especialidad de Endodoncia y Especialidad en Odontopediatría.